Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mterf1bB9EJ57 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mterf1bB9EJ57 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms