Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm6133B2RY53 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm6133B2RY53 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms