Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia1B2RXQ2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms