Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr3aB2RXC6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms