Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apba1B2RUJ5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms