Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4787B2RUD9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm4787B2RUD9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms