Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms