Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt4B2RU40 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrt4B2RU40 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms