Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JrklB2RRL2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
JrklB2RRL2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms