Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms