Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed5B2RPU8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbed5B2RPU8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed5B2RPU8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed5B2RPU8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed5B2RPU8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed5B2RPU8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed5B2RPU8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed5B2RPU8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms