Protein–RNA interactions for Protein: B2KFW1

Zscan20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan20B2KFW1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zscan20B2KFW1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan20B2KFW1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms