Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60cB1B213 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60cB1B213 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60cB1B213 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60cB1B213 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H60cB1B213 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60cB1B213 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms