Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms