Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NhsB1AV60 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms