Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spocd1B1ASB6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms