Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp36B1AQJ2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms