Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem238A9JSM3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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