Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms