Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms