Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plcb2A3KGF7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plcb2A3KGF7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms