Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pm20d2A3KG59 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms