Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra4A2RT60 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms