Protein–RNA interactions for Protein: A2AUQ8

4930402F06Rik, MCG21268, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402F06RikA2AUQ8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930402F06RikA2AUQ8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402F06RikA2AUQ8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms