Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scn3aA2ASI5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms