Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtf1A2AQ19 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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