Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms