Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SetxA2AKX3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms