Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn6A2AJB9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms