Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms