Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap5A2AGT5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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