Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc163A2AGD7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc163A2AGD7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms