Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2dnl2A2AFH2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms