Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp8nlA2ABX0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms