Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms