Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprfA2A8L5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprfA2A8L5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms