Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trav12-2A0N8N6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trav12-2A0N8N6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trav12-2A0N8N6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trav12-2A0N8N6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trav12-2A0N8N6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trav12-2A0N8N6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trav12-2A0N8N6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trav12-2A0N8N6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trav12-2A0N8N6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trav12-2A0N8N6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trav12-2A0N8N6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Trav12-2A0N8N6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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