Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700028J19RikA0A0U1RP08 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms