Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm28980-201ENSMUST00000187877 219 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms