Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hdac5Q9Z2V6 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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