Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Hdac6Q9Z2V5 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Hdac6Q9Z2V5 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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Hdac6Q9Z2V5 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Hdac6Q9Z2V5 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Hdac6Q9Z2V5 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Hdac6Q9Z2V5 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
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Hdac6Q9Z2V5 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
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Hdac6Q9Z2V5 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Hdac6Q9Z2V5 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Hdac6Q9Z2V5 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Hdac6Q9Z2V5 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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