Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.2 ms