Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr1219-205ENSMUST00000217421 5849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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Col5a3Q9JLI2 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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Col5a3Q9JLI2 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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Col5a3Q9JLI2 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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