Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms