Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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