Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms