Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm38404-201ENSMUST00000202005 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm42848-201ENSMUST00000201477 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Sox12Q04890 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Sox12Q04890 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Sox12Q04890 Csf3r-202ENSMUST00000106162 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Sox12Q04890 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Sox12Q04890 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sox12Q04890 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sox12Q04890 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Sox12Q04890 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Sox12Q04890 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sox12Q04890 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Sox12Q04890 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sox12Q04890 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sox12Q04890 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sox12Q04890 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sox12Q04890 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sox12Q04890 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.3 ms