Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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Sh3bp1P55194 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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Sh3bp1P55194 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Sh3bp1P55194 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Sh3bp1P55194 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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Sh3bp1P55194 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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Sh3bp1P55194 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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Sh3bp1P55194 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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Sh3bp1P55194 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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