Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rfx1P48377 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms