Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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Hoxd9P28357 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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